克孜勒苏柯尔克孜自治州首府在阿图什市，距乌鲁木齐1433公里，位于新疆最西部，地处天山南麓，昆仑山北段，塔里木盆地西北部。地处东径73°26′05″—78°59′02″,北纬37°41′28″—41°49′41″之间。东部与阿克苏地区的乌什、柯坪县为邻，东南部与喀什地区的巴楚、伽师、疏勒、英吉沙、莎车交界，西南部与喀什地区的塔什库尔干县接壤，北部和西部隔天山南脉与吉尔吉斯斯坦和塔吉克斯坦毗连。东西长约500公里，南北宽约140公里。
国境线长达1170余公里。地势西北高东南低，海拔高度在1197—7719米，平均海拔3000米，境内地形相对高差6522米。南部、西部和北部是高山地带，地处帕米尔高原和南天山之间，是自治州主要的牧业区，西昆仑末端屹立着公格尔峰和慕士塔格峰，海拔分别为7719米和7546米，是新疆境内的高峰之冠。东南部是州内唯一的山麓平原，海拔在1197---1500米之间，是自治州主要的农业区。
自治州境内复杂的地质构造，造成了有利的成矿条件，已初步探明的矿藏有煤、铁、铜、铅、锌、金、银、宝石、玉石、水晶、冰洲石、云母、沸石、莹石、重晶石、盐、石灰石、粘土等达55种.现辖有阿图什市、阿克陶县、乌恰县和阿合奇县共三县一市，共有32个乡，5个镇，222个村。全州土地总面积7.25万平方公里，人口密度5.8人/平方公里。
根据1998年统计资料显示：总人口42.6万人，其中：城镇人口9.76万人，乡村人口32.84万人，在总人口中，柯尔克孜族12.63万人；维吾尔族27.15万人；汉族2.29万人。全州耕地面积62万亩，可利用草场面积4479万亩。
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